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天大生物信息中心新型冠狀病毒基因組注釋數據庫上線向全球開放服務

      2020-01-31       

天大生物信息中心新型冠狀病毒基因組注釋數據庫上線向全球開放服務

本站訊(記者 趙暉)疫情就是命令!30日從天津大學獲悉,該校生物信息中心新型冠狀病毒基因組注釋數據庫上線,并納入中國國家基因組科學數據中心向全球開放服務。

新型冠狀病毒基因組注釋數據庫 ZCURVE_CoV Database 網站截圖

面對疫情加快蔓延的嚴重形勢,科技界正在爭分奪秒與病毒抗爭,開展病毒防治相關藥物的研發。鑒于目前在美國NCBI網站上公布的新型冠狀病毒全基因組序列,很大一部分缺少詳細的基因組注釋,尤其是對多聚蛋白酶切位點的注釋,天津大學生物信息中心的高峰教授、羅昊博士采用已研發的ZCURVE_CoV系列軟件對包括新型冠狀病毒(2019-nCoV)在內的兩千余株冠狀病毒的基因組進行了基因識別和酶切位點預測,并以數據庫(ZCURVE_CoV Database)的形式提供網上服務(http://tubic.tju.edu.cn/CoVdb或http://tubic.org/CoVdb/)。該數據庫有望為新型冠狀病毒基因組結構、基因功能及病毒起源與變異以及藥物研發等重大問題的研究提供科學根據。作為合作單位之一,該數據庫也可在國家基因組科學數據中心(https://bigd.big.ac.cn/)網站通過跨庫檢索形式訪問。

據悉,2003年,在全國人民眾志成城抗擊SARS期間,天津大學生物信息中心師生在張春霆院士帶領下,積極投入SARS冠狀病毒基因組的研究工作,研發出了專門適用于冠狀病毒的基因識別及多聚蛋白酶切位點預測的系列軟件ZCURVE_CoV(http://tubic.tju.edu.cn/sars/),曾被應用于人、蝙蝠等冠狀病毒的基因組注釋。迄今為止,已有國內外數千家研究機構的科研人員訪問天津大學生物信息中心的SARS網站,其中包括世界衛生組織、斯坦福大學、約翰霍普金斯大學、巴斯德研究所、香港大學等著名科研機構和大學。為此,天津市政府曾于2003年授予張春霆院士抗擊非典先進個人證書和獎章。

(編輯 彭莉)


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